राज्य के मदरसों को शैक्षणिक सत्र 2026-27 से धार्मिक शिक्षा के लिए नए सिरे से मान्यता लेनी होगी। उन्हें राज्य अल्पसंख्यक शिक्षा प्राधिकरण द्वारा मान्यता दी जाएगी। मान्यता इस शर्त पर मिलेगी कि मदरसों को धार्मिक शिक्षा के लिए प्राधिकरण द्वारा तैयार पाठ्यक्रम पढ़ाना होगा।
उत्तराखंड अल्पसंख्यक शिक्षा विधेयक 2025 में यह स्पष्ट किया गया है कि राज्य में उत्तराखंड मदरसा शिक्षा बोर्ड द्वारा मान्यता प्राप्त कोई भी मदरसा शैक्षणिक सत्र 2025-26 के अंत तक ही शिक्षा प्रदान कर सकेगा। ऐसे मदरसों को शैक्षणिक सत्र 2026-27 से धार्मिक शिक्षा प्रदान करने के लिए पुनः मान्यता लेनी होगी।
अधिनियम में यह भी कहा गया है कि किसी शैक्षणिक संस्थान को अल्पसंख्यक शैक्षणिक संस्थान के रूप में मान्यता देने के लिए आवेदन पर, प्राधिकरण के पास धारा 14 में उल्लिखित अनिवार्य शर्तों के आधार पर आधिकारिक तौर पर शैक्षणिक संस्थान को अल्पसंख्यक शैक्षणिक संस्थान के रूप में मान्यता देने या इसे अस्वीकार करने की शक्ति होगी।
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